Синдзи, погруженный в мир внутренних конфликтов и глубоких сомнений, уже начинает находить уверенность в своей роли пилота боевого робота «Ева-01». Его жизнь становится более насыщенной, когда на горизонте появляются две совершенно разные девушки, каждая из которых по-своему привносит необычные перспективы и восприятие в управление гигантскими...